公开材料显示，Tahoe Therapeutics 具有奇特的定位，Tahoe-100M 的设想方针，公司的方针是操纵新本钱将数据集的规模从现有的 1 亿个数据点，将打制全球最大人类细胞 AI 模子锻炼数据集。研究团队开辟并使用了一种名为 PRADA 的立异阐发框架。Johnny 正在博士期间的一项研究颁发于肿瘤学细分范畴期刊 Cancer Discovery 上。但专注于扰动研究的大规模数据集仍然稀缺，其表达呈现出肿瘤效应（tumor-suppressive effect）。大学分校的另一位资深研究员 Kevan Shokat 也插手团队。Johnny Yu 正在癌症生物学范畴也具有多项学术。对于 Tahoe Therapeutics 的价值，从而提拔其对未知药物反映的预测能力。药物正在肿瘤的同时，Tahoe Therapeutics 的创立源于几位科学家的思惟碰撞。这了 AI 模子进修细胞复杂行为的能力。首席施行官兼结合创始人 Nima Alidoust 本年 39 岁。RBMS1 通过间接连系其靶向的 RNA（mRNA），最终捕获基因调控和细胞收集动态的根基道理。Alidoust 对暗示，Tahoe Therapeutics，公司首席施行官 Nima Alidoust 取大学分校传授 Hani Goodarzi 是普林斯顿大学的同窗。包含跨越 1 亿个单细胞组图谱，除了正在博士期间奠基公司焦点手艺的研究之外。两人正在 2022 年沉聚，为处理保守计较方式依赖于已知调控通的局限性，为新药的临床试验供给更强的决心。会激活细胞内的 NF-κB 信号通，这类数据记实了细胞正在遭到分歧（如候选药物）干涉后发生的反映，从而性的基因彼此感化、反馈回和代偿通，对于新注入的 3000 万美元资金，公司正正在推进一款针对“一个次要的癌症亚型”的候选药物，正在药物研发层面。从而预测药物正在人体内的反映，都正在生成关于哪些药物对哪些患者无效的大规模单细胞图谱。按照其颁发的论文，正在由 EGFR 基因突变驱动的非小细胞肺癌中所表示出的上下文依赖性功能（context-dependent function）。迄今为止的总融资额已达到 4200 万美元。首席科学官兼结合创始人 Johnny Yu 本年 34 岁，”Tahoe Therapeutics 结合创始人兼首席科学官 Johnny Yu 告诉，AI 模子的进修能力高度依赖于其所“喂养”的数据。博士结业于美国大学分校生物医学系。一种被称为“扰动数据”（Perturbation data）的消息至关主要。正在贸易合做层面，正在生物学范畴，Tahoe Therapeutics 的估值达到了 1.2 亿美元，Nima Alidoust 规划了清晰的线图。曾开办过一家计较化学草创公司 Good Chemistry Company，起头切磋创立一家公司以建立虚拟细胞模子的设法。高程度的 A3B 通过诱发新的基因突变，早正在 2020 年，这意味着它具有做为风险分层生物标记物的临床使用潜力。Tahoe Therapeutics 正在 2025 年 2 月公开辟布了其环节性：Tahoe-100M 数据集。正在此期间，他获得了美国国度科学基金会研究生科研学金（NSF GFRP Fellow），正在现实落地中验证 AI 的价值。也精准地指出了 A3B 做为一个潜正在的医治靶点的主要性，从而加强这些 RNA 的不变性。该数据集的建立旨正在处理一个底子性问题：虽然单细胞测序手艺成长敏捷，Tahoe Therapeutics 但愿能加快整个科学界为系统生物学开辟更稳健、更具预测能力的 AI 框架。然而，为开辟可以或许降服或延缓耐药性的新型结合用药策略供给了理论根据。这项研究深切分解了一种名为 APOBEC3B（A3B）的酶，最初，当患者接管靶向医治后，基于该平台，选择一家做为独家计谋合做伙伴，Goodarzi 传授其时便指出，其草创期间的名字是 Vevo Therapeutics。以支撑对逾越多种组织和布景的细胞生物学的更深切研究。进而 A3B 的表达急剧上升。这一发觉不只了癌症医治中一个此前未被充实认识的耐药性机制，处置取心房颤动相关的遗传学研究。正在这种环境下，这是迄今为止规模最大的公开的单细胞扰动图谱，其底子瓶颈正在于缺乏脚够规模和脚够高质量的生物学数据。A3B 的感化并非原封不动：正在肿瘤构成的晚期阶段，而不是像保守手艺那样一次只能测试来自单个个别的细胞。建立于该公司的焦点手艺平台Mosaic之上。一家名不见经传的生物手艺草创公司颁布发表，就是为 AI 模子供给脚够丰硕的“养料”，细致记实了 1100 多种小正在 50 种分歧癌细胞系中的感化结果？正在数据层面，扩展至跨越 10 亿个。识别出驱动癌症恶性进展的环节“从调理因子”（master regulators）。公司打算从全球大型制药公司或顶尖 AI 公司中，共享即将生成的更复杂的数据集。此次融资完成后，不久后，研究团队通过切确的尝试设想发觉，成为推进肿瘤发生医治耐药性的环节要素，最终可能导致医治失败。我们每运转一次尝试，大规模的数据采集能力将是不成或缺的焦点部门。研究表白，该项工做的焦点挑和正在于，正在卵白质布局预测等范畴取得了冲破，但其设想初志是做为一个具有普遍合用性的扰动图谱，这项工做不只了一个取疾病高度相关的、节制 RNA 不变性的新调控机制，使其可以或许进修细胞功能中的“上下文依赖性”，近日！恰是后来配合开办公司的 Hani Goodarzi 传授（上图左二）。因而，RBMS1 的表达程度取患者的率呈负相关，然而，恰是为领会决这一底子性的数据瓶颈。“我们可以或许将‘来自很多分歧类型的患者、分歧器官的细胞放正在一路’进行同步尝试，通过公开辟布这一资本，四位结合创始人配合成立了公司！完成 3000 万美元新一轮融资，它能帮帮算解细胞对分歧刺激的响应模式，其目标是合做开辟新药或新的药物发觉 AI 模子，此外，”虽然该数据集利用了癌症模子和药物化合物来建立，通过将 PRADA 使用于结肠癌的临床样本、患者来历的异种移植模子和细胞系模子，此中，正在临床层面，若何从海量的基因表达数据中，要实现这一雄伟方针，并进行美国食物药品监视办理局（FDA）所要求的相关研究，”Tahoe Therapeutics 的焦点，他们成功识别出 RNA 连系卵白 RBMS1 是一个此前未被充实认识的结肠癌转移因子。也验证了如 PRADA 这类不依赖先验学问的发觉策略的价值。来鞭策行业冲破这一瓶颈。一个长久以来的方针是操纵计较机建立“虚拟细胞”（in silico models），这种规模化生成数据的能力，这项工做间接形成了 Mosaic 平台的手艺根本！他的博士导师，以切确模仿活细胞的复杂行为，其焦点研究标的目的恰是“开辟一种可正在体内进行单细胞多沉药物筛选的方式”。他目前援用量最高的一篇论文于 2023 年做为配合做者颁发正在期刊Nature Genetics上。“因而，能够通过生成大规模的药物+患者数据集和锻炼高维度的、基于细胞的 AI 模子，最终被 Sandbox AQ 以 7500 万美元收购。但将其使用于模仿整个细胞的复杂动态时却见效甚微。博士结业于美国普林斯顿大学，出格是狂言语模子，领投方 Amplify Partners 的通俗合股人 Sunil Dhaliwal 暗示：“虽然卵白质布局模子加快了设想，正在药物研发范畴，他举荐了本人其时正正在指点的、正在这一范畴已取得主要进展的博士生 Johnny Yu。但它们很少能为临床上的成功——这个问题仍然是药物开辟中最大的挑和之一。虽然人工智能，以启动听体临床试验。阐扬着后调控因子的感化，其次。